Не доработав контракт получил воспаление легких. После чего прошел обследование в Чили, где был осмотр, потом отправили домой, сейчас прохожу лечение в больнице позвонил в крюинг, мне отказали в оплате больничного вы можете помочь?

Отказать в лечении не имеют права. Будет нарушение всего что только можно. Вам нужно открыть больничный и проходить лечение. И чтобы обязательно было подтверждение лечения. Без чеков и подтверждения лечения — шансов получить больничные нет.
Если вы уже выздоровели, то покрытие будет ровно до того момента, пока лечились.
Нужно уточнить название судна и, желательно, на руках иметь копию контракта.